إيماناً  بدور التجارة في توثيق علاقات التعاون العربي الإفريقي وأثرها الإيجابي في العملية التنموية، قام المصرف بالإسهام في رأس مال البنك الأفريقي للتصدير والاستيراد بمبلغ 10 ملايين دولار أمريكي، كما وضع برنامجاً لتمويل الصادرات العربية إلى البلدان الأفريقية المستفيدة من عونه، وخصص له مبلغ 100 مليون دولار، منها 50 مليوناً أدارها البنك الإسلامي للتنمية بناءً على اتفاق مع المصرف في هذا الشأن. وقد تم منذ عام 1998 الموافقة على تمويل 14 عملية قيمتها الإجمالية 83.7 مليون دولار، وذلك لتمويل عمليات التصدير من الدول العربية إلى الدول الأفريقية، منها 5 عمليات في عام 2003 بمبلغ 29.5 مليون دولار مع كل من السنغال وموريشص وكينيا وجامبيا وزيمبابوي.

 أما العمليات السابقة فكانت لفائدة كل من : تنزانيا وغينيا وموريشص ويوغندا وزيمبابوي وسيشيل والسنغال. ويبلغ صافي ما خصص لهذه العمليات 63.4 مليون دولار، وذلك بعد استبعاد العمليات الملغاة مع بعض الدول.