إيماناَ بدور التجارة في توثيق علاقات التعاون العربي الإفريقي وأثرها الإيجابي في العملية التنموية، قام المصرف بالإسهام في رأس مال البنك الإفريقي للتصدير والإستيراد بمبلغ 10 مليون دولار، كما وضع برنامجاَ لتمويل الصادرات العربية الى الدول الإفريقية المستفيدة من عونه وخصص له 100 مليون دولار منها 75 مليون أدارها البنك الإسلامي للتنمية ثم أسندت إدارتها بعد ذلك إلى المؤسسة الإسلامية الدولية لتمويل التجارة (ITFC) بناءاَ على اتفاق مع المصرف في هذا الشأن (اعتبارا من فبراير 2008). وقد تم منذ عام 1998 تمويل 26 عملية قيمتها الإجمالية 146.682 مليون دولار وذلك لتمويل عمليات التصدير من الدول العربية إلى دول إفريقية وهي: السنغال – موريشص – كينيا – جامبيا – زمبابوى – تنزانيا – سيشل – غينيا - زامبيا - كوت ديفوار.