L’intérêt de la Banque pour les opérations commerciales découle du fait de leur rôle dans le renforcement de la coopération arabo-africiane et dans le développement. Pour ce, la Banque a participé au capital de la Banque Africaine de l’Export et de l’Import pour un montant de 10 millions de dollars, et a mis en place un programme de financement des exportations arabes vers les pays africains bénéficiaires de son aide. Le montant initial affecté à ce programme a été 50 millions de dollars. Il a été par la suite porté, sur décision du Conseil des Gouverneurs de la Banque à 100 millions de dollars. Le Conseil a, par ailleurs, autorisé la Banque à gérer totalement of partiellement ce programme ou confier sa gestion à une ou plusieurs instituions. La gestion du programme a été confiée lors de sa création, à la Banque Islamique du Développement. La BADEA compte procéder à la gestion directe d’une partie du programme du financement des exportations dès l’accomplissement des formalités et procédures y afférentes.

Depuis 1998, la Banque a approuvé le financement de 14 opérations d’un montant total de 83,7 millions de dollars, y compris 5 opérations de 29,5 millions de dollars en 2003 au profit de Sénégal, Maurice, Kenya, Gambie et Zimbabwe. Les autres opérations financées dans le cadre du programme ont profité à la Tanzanie, à la Guinée, à l’île Maurice, à l’Ouganda, au Zimbabwe, aux Seychelles et au Sénégal. Le montant ayant été alloué à ces opérations a atteint 63,4 millions de dollars, sans les opérations annulées.